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生物信息學專業MySQL數據庫課程教學方法探討論文
摘要:該文根據MySQL數據庫特點,結合生物信息學專業特色,提出了理論與實踐結合、項目與任務結合、考核與教學反思結合的教學方法,調動學生的學習主動性,使學生充分認識到MySQL數據庫課程在生物信息學數據存儲、數據處理等方面的重要作用,督促學生全面掌握數據庫相關知識,通過項目與任務結合培養了學生的實踐能力,很好地完成了教學任務,達到了預期效果。
關鍵詞:MySQL數據庫生物信息學
中圖分類號:G64文獻標識碼:A文章編號:1674-098X(2016)02(b)-0141-02
隨著計算機技術和生物技術的快速發展,MySQL數據庫課程不僅是計算機類專業、信息管理專業的重要專業課程,也是生物信息學專業的必修課程。MySQL數據庫作為應用型課程,其課程體系注重培養學生利用數據庫技術解決實際問題的能力,然而由于專業方向、教學手段、考核方式等方面的限制,容易使學生學習目標不明確、缺乏學習興趣,導致學習效果較差。如何改變生物信息學專業的MySQL數據庫教學現狀,是值得深入思考的問題,該文從教學實踐出發,探討MySQL數據庫課程在生物信息學專業中的重要性和教學方法。
1MySQL數據庫特點
MySQL由瑞典MySQLAB公司開發的一款開放源碼的中小型關系數據庫管理系統,是當前網站開發中尤其是PHP開發中使用最為廣泛的數據庫。MySQL支持多線程充分利用CPU資源,提供TCP/IP、ODBC和JDBC等多種數據庫連接途徑,支持Linux、Solaris和Windows等多種操作系統,使用系統核心提供的多線程機制提供完全的多線程運行模式,提供了面向C、C++、Java、Perl、PHP和Python等編程語言接口,優化SQL查詢算法,可有效地提高查詢速度。它具有操作簡單、體積小、速度快等優點,語法簡單,容易被學生理解和接受,在編寫網站應用程序時,幾乎離不開數據庫,所以,在教學中選取MySQL作為教學用數據庫管理系統。
2MySQL數據庫課程教學方法研究
MySQL數據庫具有很多特點,是網站應用程序不可缺少的重要部分。對于生物信息學專業的學生而言,使用很多數據庫,如,NCBI、UCSC等進行生物數據檢索,而獲得數據后,如何進行數據存儲、數據處理和分析成為一個重點難點問題。學習MySQL數據庫課程,能使學生快速地掌握使用方法,提高處理數據效率。為保證良好的MySQL數據庫教學效果,從以下幾方面開展教學方法研究和實踐。
2.1理論與實踐緊密結合,調動學生學習興趣
根據MySQL數據庫理論性和應用性強的特點,為使學生全面掌握數據庫基本知識和技能,提出理論與實踐緊密結合的教學方法,重視課堂理論知識的傳授,緊密結合實踐訓練。例如:理論學習關系數據庫模型時,引入實例,指導學生從GenBank數據庫獲取核酸和蛋白質序列,調動學生主動思考,如何存儲為關系模型數據,加深學生對關系模型的理解和應用,并為同學分配任務,進行核酸和蛋白質序列的查詢、修改關系操作,通過這種具有專業特色的理論學習與實踐訓練相結合的教學方法,使學生掌握了MySQL數據庫理論知識的同時,也激勵同學主動開展實踐訓練,能夠使枯燥的理論知識變得生動有趣,使學生認識到MySQL數據庫課程的重要性,進一步促進生物信息學專業課程的學習。
2.2項目與任務驅動結合,培養學生動手能力
針對MySQL數據庫課程的特點,開展項目與任務緊密結合的教學方法。總體上將課程劃分為若干階段的教學過程,并將教學過程分解在一個項目案例MySQL數據庫系統中。例如:構建人類疾病相關基因數據庫系統,將該項目劃分按照數據庫設計周期劃分為以下6個階段:需求分析階段、概念結構設計階段、邏輯結構高設計階段、物理結構設計階段,數據庫實施階段和數據庫運行與維護階段,分配子項目和子任務,包括人類疾病相關基因數據的獲得與處理、轉化為關系模型結構數據、數據模式分解、MySQL數據庫構建、關系表構建、數據類型設置、數據導入、創建索引、視圖、觸發器以及存儲過程等,充分調動學生學習的主動性,發揮主觀能動性,用項目和任務引導學生學習知識點,即把知識點的講授貫穿在實際應用項目的開發過程之中,指導學生掌握實際的MySQL數據庫的分析、設計與開發過程,培養學生動手研發能力。
2.3考核與教學反思結合,優化教學內容
目前,MySQL的數據庫課程理論與實踐考核存在考核過程效率低、考核內容覆蓋面小、考核方法少等問題使教師難以全面掌握學生的學習效果,所以,在考核過程中督促學生全面掌握數據庫相關知識,提出了可靠的理論與實踐考核方法,即制訂合理的考核內容計劃,構建全面的數據庫、試題庫、理論試題庫和實踐試題庫,全面覆蓋表與數據庫的創建、表結構的修改及索引的創建、數據操作、查詢及視圖、觸發器與存儲過程的創建、用戶與權限管理等,結合生物信息學專業知識進行理論和實踐考試,保證理論考試和實踐考試能夠全面真實地反映學生的掌握水平。同時,進行教學反思,即時糾正教學過程中還存在的問題,對于課堂上學生提出的一些獨特見解給予充分肯定,推廣的好方法、好思路、好見解,完善教學過程,拓寬教師的教學思路,提高教學水平。
3結語
MySQL數據庫課程是生物信息學專業的重要專業基礎課,具有較強的應用性。該文根據MySQL數據庫特點,結合生物信息學專業特色,提出了理論與實踐結合、項目與任務結合、考核與教學反思結合的教學方法,不僅調動學生的學習主動性,而且在實踐過程中使學生充分認識到MySQL數據庫課程在生物信息學數據存儲、數據處理等方面的重要作用,通過數據庫試題庫進行理論與實踐考核,督促學生全面掌握數據庫相關知識,通過項目與任務結合培養了學生的實踐能力,很好地完成了教學任務,但具體教學過程中可能還會存在一些問題,這需要教師根據課程環境進行即時調整不斷地完善,使MySQL數據庫課程在生物信息學專業中發揮更重要的作用。
參考文獻
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